自然界的許多物質都可以作為抗原，但用作診斷試劑的抗原必須是單一特異性的，即純化的抗原，所以必須將所需的抗原從復雜的組分中提取出來，下面介紹一些主要的制備方法。
顆粒性抗原的制備
顆粒性抗原主要指細胞抗原或細菌抗原，zui常用的細胞抗原是制備溶血素用的綿羊紅細胞。它的制備方法比較簡單，采用新鮮綿羊紅細胞，以無菌鹽水洗滌3次，zui后配成106個/mL濃度的細胞懸液即可。細菌抗原多用液體或固體培養物經過集菌后處理制得。有些蟲卵、細胞膜成分都可制成顆粒抗原。顆粒抗原呈乳濁液，多采用靜脈內免疫法，較少采用佐劑作皮內注射。
可溶性抗原主要包括蛋白質、糖蛋白、脂蛋白、細菌毒素、酶、補體等。但是這些蛋白的成分比較復雜，免疫前需要純化，常用的純化過程按以下步驟進行。
（1）組織和細胞粗抗原的制備 將新鮮或超低溫保存的樣品組織清洗干凈后，剪成小塊后進行粉碎，常用的粉碎方法有高速組織搗碎機法和研磨法，粉碎后的組織勻漿液離心后上清液中就含有可提取可溶性抗原的材料――粗抗原。
（2）組織細胞可溶性抗原的制備 可用于制備抗原用的細胞包括正常細胞、病理細胞或傳代細胞。制備抗原時需將細胞破碎后釋放出抗原。制備方法有反復凍融法、冷熱交替法、超聲破碎法、自溶法、溶菌酶處理法等。
（3）超速離心和梯度密度離心法 超速離心是分離亞細胞部分及蛋白質大分子是有效手段，它又分為差速離心和梯度離心。離心純化抗原的方法是依據抗原的比重特點進行分離，目前僅適用于少部分大分子抗原，如IgM、C19、甲狀腺蛋白等；對于大量的中、小分子量蛋白質，多不適合用離心的方法進行分離純化。
（4）選擇性沉淀法 選擇性沉淀是采用各種沉淀劑或改變某些條件促使抗原成分沉淀，從而達到純化的目的，主要包括鹽析沉淀法、有機溶劑沉淀法、水溶性非離子型聚合物沉淀法等。
（5）親和色譜、凝膠過濾和離子交換色譜 采用各種色譜手段，可將某種蛋白質從復雜組分中純化出來。
（6）純化抗原的鑒定 常用的方法有聚丙烯胺凝膠電泳法、結晶法、免疫電泳法、免疫雙擴散法等。一般常把幾種方法聯合使用才能判斷出可靠的結果。
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